إيمانا من المجلس بضرورة العمل الجماعي المشترك  لتعزيز وتنمية حماية حقوق الإنسان والإسهام في نشر ثقافتها وضمان ممارستها، فقد قام المجلس بعقد بروتوكولات تعاون مشترك مع العديد من الجهات الحكومية وغير الحكومية والمؤسسات التعليمية والجمعيات.
 ويوضح الجدول الأتي الجهات المصرية التي يتعاون معها المجلس لنشر ثقافة حقوق الإنسان 
 

	مؤسسة بداية لتمكين الشباب
	المركز المصري لتنمية الوعي بالقانون
	البرنامج العربي لنشطاء حقوق الإنسان
	وزارة الصحة والسكان ( الأمانة العامة للصحة النفسية)
	كلية الإعلام – جامعة القاهرة
	الإتحاد العام للجمعيات والمؤسسات الأهلية
	المركز القومي للبحوث الإجتماعية والجنائية
	مركز بحوث ودراسات حقوق الإنسان بجامعة أسيوط
	المؤسسة المصرية للتدريب وحقوق الإنسان
	مؤسسة ناس للإستشارات والتدريب والتقييم للافراد المعاقين
	المجلس القومي للمرأة
	المجلس الأعلي للجامعات
	الإتحاد العام للصحفين العرب
	جمعية شموع لحقوق الإنسان ورعاية الأفراد المعاقين
	مؤسسة النقيب للتدريب ودعم الديمقراطية
	المجلس الاعلي للصحافة
	المنظمة العربية للإصلاح الجنائي
	برنامج الديمقراطية وحقوق الإنسان- كلية الإقتصاد والعلوم السياسية بجامعة القاهرة
	جامعة الزقازيق
	المعهد الديمقراطي المصري
	الجمعية المصرية للمشاركة والتنمية المستدامة
	الجمعية المصرية للحقوق الإقتصادية والإجتماعية
	الهيئة العامة لتعليم الكبار
	الهيئة العامة لقصور الثقافة
	ماعت للسلام والتنمية وحقوق الإنسان
	مؤسسة عالم واحد للتنمية ورعاية المجتمع المدني